Μαραθώνιες διαπραγματεύσεις πραγματοποιεί το υπουργείο Εσωτερικών με τους μεταφορείς για τη μετακίνηση των 200.000 μαθητών. Οι διαπραγματεύσεις και οι παρασκηνιακές διεργασίες θα πρέπει να ολοκληρωθούν άμεσα, καθώς σε διαφορετική περίπτωση από τις 9 Ιανουαρίου 2012 οι μαθητές δεν θα μπορούν να μετακινηθούν από τον τόπο διαμονής τους στα σχολεία. Σε συνάντηση που είχε ο αρμόδιος υφυπουργός Πάρις Κουκουλόπουλος με το προεδρείο της ΚΕΔΕ (Κεντρικής Ένωσης Δήμων Ελλάδος) και τους προέδρους των Περιφερειακών Ενώσεων Δήμων Ελλάδος, την Τετάρτη 28 Δεκεμβρίου, ξεκαθαρίστηκε ότι, σε περίπτωση που δεν επιτευχθεί συμφωνία για χαμηλότερο κόστος, η κυβέρνηση θα υποχρεωθεί να προχωρήσει σε παράταση των ισχυουσών συμβάσεων. Αυτό θα έχει, όμως, ως αποτέλεσμα το επιπλέον κόστος που θα προκύψει να «εξασφαλιστεί» από πόρους της Αυτοδιοίκησης. Οι ισχύουσες συμβάσεις λήγουν και τυπικά στις 31 Δεκεμβρίου 2011, με συνέπεια από τον Ιανουάριο του 2012 και μέχρι το τέλος της σχολικής χρονιάς να παραμένει «ακάλυπτη» η μεταφορά. Η κυβέρνηση στο πλαίσιο του μνημονίου έχει δεσμευτεί η δαπάνη για τη μεταφορά των μαθητών να μειωθεί κατά 50 εκατ. ευρώ σε σχέση με το 2011. Από 200 εκατ. ευρώ, δηλαδή, υπολογίζεται να κυμανθεί στα 140-150 εκατ. ευρώ. Αν και έχει επιτευχθεί συμφωνία σε ορισμένες περιοχές, όπως για παράδειγμα το Αγρίνιο, ωστόσο η πλειονότητα των δήμων της χώρας δεν έχει καταφέρει να ολοκληρώσει τις διαδικασίες ανάθεσης, καθώς τα ΚΤΕΛ αρνούνται να συμμετάσχουν στις διαδικασίες που έχουν κινηθεί και να κηρύσσονται άγονοι οι διαγωνισμοί.
Το υπουργείο Εσωτερικών προσανατολίζεται σε βελτιωτικές κινήσεις προκειμένου να αρθούν οι αντιρρήσεις των μεταφορέων και τα προβλήματα που έχουν προκύψει κατά τις διαγωνιστικές διαδικασίες. Μεταξύ άλλων καταβάλλεται προσπάθεια ώστε μέχρι τον Φεβρουάριο να εξοφληθούν οι οφειλές του κράτους προς τους μεταφορείς για το 2011 από το πρόγραμμα μεταφοράς μαθητών, καθώς και τα χρήματα που επίσης του οφείλονται από το πρόγραμμα «ΣΥΝ- ΚΟΙΝΩΝΙΑ». Για τα επιμέρους προβλήματα που υπάρχουν, το υπουργείο Εσωτερικών έχει δεσμευθεί ότι θα εξεταστούν και θα κατατεθούν βελτιωτικές προτάσεις προς τους μεταφορείς, προκειμένου να διασφαλιστεί η απρόσκοπτη μεταφορά των μαθητών.
Σύμφωνα με πληροφορίες, το υπουργείο εξετάζει θετικά το να παραταθούν οι συμβάσεις των μεταφορέων για τη μετακίνηση των ατόμων με ειδικές ανάγκες, ενώ φαίνεται να διαμορφώνεται ένα πλαίσιο συμφωνίας και με τους ιδιοκτήτες ταξί, οι οποίοι σε ορισμένες περιπτώσεις έχει διαπιστωθεί ότι δεν καλύπτουν ούτε το κόστος των καυσίμων. Σε σχέση με τα ΚΤΕΛ, αναζητείται φόρμουλα προκειμένου να διαφοροποιηθεί το ποσό χρέωσης ανά χιλιομετρική απόσταση, ανάλογα με το αν πρόκειται για έμφορτη ή μη μετακίνηση. Δηλαδή θα χρεώνονται διαφορετικά τα δρομολόγια που είναι γεμάτα τα οχήματα και διαφορετικά όταν είναι κενά, καθώς τα καύσιμα που καταναλώνονται είναι διαφορετικά στη μία και διαφορετικά στην άλλη περίπτωση.