H kατασκευή Μουσείου Ναυτικών-Ναυπηγικών Τεχνών Αιγαίου στη Σάμο, προϋπολογισμού 8.008.180,00 ευρώ, αξιολογήθηκε θετικά και εντάχθηκε στο Επιχειρησιακό Πρόγραμμα Ανταγωνιστικότητα και Επιχειρηματικότητα.
Η πρόταση που συντάχθηκε και υποβλήθηκε από τον δήμο του νησιού, στο πλαίσιο σχετικής πρόσκλησης του υπουργείου Ανάπτυξης, Ανταγωνιστικότητας και Ναυτιλίας για το Επιχειρησιακό Πρόγραμμα Ανταγωνιστικότητα και Επιχειρηματικότητα, έχει ως στόχο τη δημιουργία ενός τεχνικού θεματικού Μουσείου που θα κατασκευαστεί στο Ηραίο Σάμου. Σύμφωνα με την πρόταση, το κτιριακό σύμπλεγμα του Μουσείου αποτελείται από: υπόγειο χώρο συνολικού εμβαδού 798,08 τ.μ, τον ισόγειο χώρο συνολικού εμβαδού 740,74 τ.μ.(είσοδος, εκθεσιακοί χώροι, αίθουσα εκδηλώσεων και περιοδικών εκθέσεων, διοίκηση, εργαστήριο συντήρησης εκθεμάτων και μουσειακών τεχνικών εφαρμογών),τον χώρο ορόφου συνολικού εμβαδού 608,51 τ.μ.(εκθεσιακοί χώροι, χώρος ερευνητικών προγραμμάτων του Πανεπιστημίου Αιγαίου, βιβλιοθήκη, χώρος εκπαιδευτικών προγραμμάτων και αναψυκτήριο). Η πρόταση προβλέπει επίσης την ύπαρξη υπαίθριου χώρου έκθεσης, συνολικού εμβαδού 1099,40 τ.μ, ο οποίος θα διαμορφωθεί για να φιλοξενεί τα σκάφη του μουσείου, και θα είναι οργανωμένος για να μπορεί να παρέχει την υποδομή ενός παραδοσιακού ναυπηγείου.