Στο Ευρωπαϊκό Δικαστήριο παρέπεμψε η Ευρωπαϊκή Επιτροπή τη Σλοβακία λόγω μη συμμόρφωσής της στην οδηγία της ΕΕ για τους χώρους υγειονομικής ταφής απορριμμάτων, που προβλέπει το κλείσιμο και την αποκατάστασή τους.
Σύμφωνα με την ευρωπαϊκή οδηγία, τα κράτη μέλη έπρεπε να κλείσουν και να αποκαταστήσουν παλιούς χώρους υγειονομικής ταφής μέχρι τις 16 Ιουλίου 2009. Η Σλοβακία τότε είχε λάβει εξαιρέσεις.
Τον Απρίλιο του 2017, η Ευρωπαϊκή Επιτροπή απηύθυνε επίσημη πρόσκληση στη Μπρατισλάβα να συμμορφωθεί με την οδηγία.
Τον Μάρτιο του 2019 επανήλθε στο θέμα, θέτοντας επίσημο αίτημα συμμόρφωσης με το δίκαιο της ΕΕ («αιτιολογημένη γνώμη»), καλώντας την να ενημερώσει για τα μέτρα που έλαβε για να συμμορφωθεί εντός συγκεκριμένης προθεσμίας.
Έκτοτε η Σλοβακία έκτοτε έκλεισε 14 μη συμμορφούμενους χώρους υγειονομικής ταφής απορριμμάτων, ωστόσο ορισμένοι αποκαταστάθηκαν και πήραν εκ νέου άδεια λειτουργίας. Επίσης επιχείρησε να τροποποιήσει τη νομοθεσία της, επιτρέποντας την επιβολή προστίμων ύψους έως και 7 εκατ. ευρώ στους φορείς εκμετάλλευσης χώρων υγειονομικής ταφής που δεν συμμορφώνονται με τους κανόνες- και η κατασκευή νέων χώρων υγειονομικής ταφής σταμάτησε.
Σύμφωνα με την Ευρωπαϊκή Επιτροπή, έως και 21 σλοβακικοί χώροι υγειονομικής ταφής εξακολουθούν να υποχρεούνται να λάβουν ορισμένα μέτρα. Παρόλο που αυτοί είναι παροπλισμένοι, δεν έχουν κλείσει οριστικά και αποκατασταθεί, όπως απαιτεί η οδηγία της ΕΕ.